از اکسیداسیون شیمیایی (از جمله الکتروشیمیایی) ، که به عنوان اکسیداسیون شیمیایی پیشرفته نیز شناخته می شود ، برای حذف برخی از آلاینده های آلی پایدار و غلظت های پس از اکسیداسیون بیوشیمیایی استفاده می شود. ضد عفونی با اکسیداسیون شیمیایی با افزودن رادیکال های هیدروکسیل مانند ازن ، کلر یا هیپوکلریت به فاضلاب باعث از بین رفتن باکتری ها و عوامل بیماری زای میکروبی می شود.